기초연구진흥 및 기술개발지원에 관한 법률에 의해 인정받은 연구개발전담부서 로서 연구기관과 협약을 맺어 기초연구사업을 진행하는 업무를 수행한다.

연구개발전담부서에서는 기초연구의 성과 등을 바탕으로 하여 국가 미래 유망 기술과 융합기술을 중점적으로 개발하기 위한 연구개발사업에 대하여 계획을 수립하고, 연도별로 연구과제를 선정하여 연구한다.